产品名称
英文名称: CY5-Oxamic acid
中文名称: CY5-草酰胺酸衍生物
中文别名: Cyanine-Oxamic Acid、菁染料-草酰胺酸衍生物、单酰胺衍生物-Cyanine染料
产品介绍
CY5-Oxamic acid 是一种将菁染料荧光骨架与草酰胺酸(Oxamic acid)相关结构组合形成的功能性荧光小分子。其分子设计与常见的Cy5-NHS、Cy5-Maleimide等直接活化型染料不同,更强调末端草酰胺酸结构所带来的极性、羧基反应空间以及后续衍生化可能性。通过在长波长荧光母核上引入这一结构,可使染料在保留明显光学响应的同时,获得进一步进行化学修饰或材料连接的结构基础。
草酰胺酸可以理解为草酸体系中的单酰胺结构之一,分子中同时包含酰胺和羧酸相关官能团。酰胺部分能够增强局部极性,并形成一定的氢键作用,而游离羧基则可根据实际实验需要进一步活化。例如,在适当偶联体系中,可先将羧基转化为更具反应性的中间体,再与含氨基或羟基的化合物连接,从而将Cy5荧光结构引入聚合物、连接体或其他功能分子中。
Cy5型菁染料通常具有延伸的多亚甲基共轭体系,这种连续电子离域结构使其吸收和发射位置位于较长波长范围。由于信号区域与绿色、黄色荧光染料存在明显区别,CY5-Oxamic acid能够用于需要多色区分的材料设计。如果体系中已经含有FITC、AF488或Cy3等信号单元,可以利用Cy5区域作为另一独立通道,从而实现不同组分的分别观察。
与带有高度活泼末端基团的染料相比,CY5-Oxamic acid中的羧酸端在常规保存条件下通常更便于管理。其本身并不会在温和环境中迅速与常见官能团发生反应,需要借助适当的活化体系才能参与偶联,因此实验者可以根据具体连接对象自行安排反应顺序。这种特点使其适合用于分步合成或后期荧光引入,而不是要求在染料加入后立即完成反应。
在聚合物修饰中,可先利用CY5-Oxamic acid的羧基与含氨基的PEG、高分子侧链或小分子连接体进行偶联,形成带有Cy5荧光标记的结构。对于微粒或固体表面,也可通过预先引入氨基层,再与经过活化的CY5-Oxamic acid反应,使荧光染料固定在材料界面。相比物理吸附方式,共价连接通常更有利于减少后续洗涤过程中的染料脱落。
CY5-Oxamic acid还可以作为合成中间体使用。研究者可以围绕羧酸端继续构建酯键、酰胺键或其他连接结构,并通过改变间隔臂长度调节Cy5与主体分子之间的空间距离。若染料距离材料表面过近,局部环境可能对荧光强度造成影响;适当增加连接链长度,有时有利于减弱界面作用,使染料保持较自由的构象状态。
进行偶联实验时,需要关注羧酸活化条件与Cy5共轭骨架之间的相容性。过强酸碱条件、长时间高温以及过于剧烈的反应体系都可能影响染料结构,因此一般应选择相对温和的反应方式。同时,菁染料对光照较为敏感,实验过程中宜减少长时间强光暴露,溶解、反应和纯化阶段均可适当采取避光措施。
产品纯化同样是影响最终结果的重要环节。若反应后残留未偶联的CY5-Oxamic acid,小分子染料可能导致背景信号升高。因此,可根据目标产物分子量及理化性质选择透析、凝胶分离、色谱或其他适合方式进行纯化。对于微粒和固体材料,可通过反复洗涤判断游离染料是否已经基本去除。
在光谱分析中,可以通过紫外可见吸收和荧光光谱观察Cy5共轭体系是否保持正常。若染料在高浓度环境中发生聚集,吸收峰形和荧光强度可能出现变化,因此配液和检测时应避免浓度过高。不同溶剂、盐浓度以及局部极性也可能造成一定光谱偏移,连续比较实验应尽量使用相同介质。
CY5-Oxamic acid可用于荧光连接体合成、聚合物标记、表面功能化、微粒荧光化、材料示踪以及多组分光学体系构建。其结构优势在于将长波长菁染料与可继续衍生的草酰胺酸单元结合,使其不仅是一个荧光信号源,也能够作为进一步化学设计的中间模块。保存时建议低温、干燥、密封并避光,配制后的溶液宜根据实验需要及时使用,以减少长时间储存造成的光谱和结构变化。
用途:科研
状态:固体/粉末/溶液
保存:冷藏
供应:西安齐岳生物科技有限公司
关于我们
西安齐岳生物科技有限公司是一家从事科研试剂,可提供PEG衍生物、磷脂材料、荧光染料、嵌段共聚物、点击化学试剂及纳米材料等产品。种类较多,规格多样,并可根据科研需求提供定制化服务。
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